SOAL UJIAN TENGAH SEMESTER

KELAS A

————————————————————————————————————————–

Mata Kuliah        : Biokom & Bioinformatik                    Semester           : Genap 2011

Tanggal                : 15 april 2011                                           Dosen                  : Fatchiyah, Ph.D

Bentuk Ujian     : Take home                                             Waktu Ujian      :

————————————————————————————————————————

Jawaban dikumpulkan paling lambat

Hari           : SENIN, 18 April 2011, jam 14.00

Ke alamat email : bioinformatika2011@gmail.com

Dengan subject : UTS Biokom-Nama mahasiswa

Setiap mhs HARUS tidak sama gen yang dipilih.

1.      Pilihlah salah satu gen apapun misal SF-1, GH, HLA-DR, 16s-RNA, atau lainnya.

A.    Analisis aligment dengan 5 species yang berbeda dengan program Bioedit baik sequence DNA maupun proteinnya.

B.     Uji kekerabatan dari semua species yang saudara pilih

2.      Berdasarkan data gen yang sudah saudara pilih, design primer untuk amplifikasi DNA sesuai dengan program yang ada di GenBank tersebut, berapa base pair (bp) hasil DNA-PCR yang diperkirakan?